Regionalne Centrum Medycyny Cyfrowej
Regionalne Centrum Medycyny Cyfrowej (RCMC)
Projekt realizowany w ramach programu:
Tworzenie i rozwój Regionalnych Centrów Medycyny Cyfrowej, skrót naboru: RCMC
Jednostka finansująca: Agencja Badań Medycznych
Numer naboru ABM/2023/2
Numer umowy: 2023/ABM/02/00004-00
Projekt pod nazwą:
Uniwersyteckie Centrum Medycyny Cyfrowej i Medycyny Precyzyjnej o specjalizacji w Kompleksowym Fenotypowaniu Chorób Cywilizacyjnych
Rozpoczęcie realizacji projektu: 2023-08-01
Zakończenie realizacji projektu: 2027-07-31
Konsorcjanci w projekcie:
- Uniwersytecki Szpital Kliniczny w Opolu – lider
- Instytut Genetyki Człowieka PAN - konsorcjant
- Sieć Badawcza Łukasiewicz – PORT Polski Ośrodek Rozwoju Technologii - konsorcjant
- Instytut Chemii Bioorganicznej PAN Poznańskie Centrum Superkomputerowo-Sieciowe - konsorcjant
- Uniwersytet Opolski – konsorcjant
Wartość projektu: 30 000 000,00 zł
Wartość dofinansowania: 30 000 000,00 zł
Krótki opis projektu:
Projekt polega na utworzeniu Regionalnego Centrum Medycyny Cyfrowej oraz przeprowadzaniu badań naukowych w oparciu o dane i procesy funkcjonujące w tworzonym Regionalnym Centrum Medycyny Cyfrowej.
Długoterminowo Regionalne Centrum Medycyny Cyfrowej będzie służyć jako platforma naukowo-badawcza zwiększająca liczbę i potencjał badań klinicznych, biomedycznych badań translacyjnych i podstawowych.
Badania naukowe przeprowadzone w czasie projektu będą dotyczyć obszarów medycyny spersonalizowanej, będą oparte na nowatorskich rozwiązaniach, w ścisłej współpracy z konsorcjantami, jednocześnie zademonstrują potencjał Regionalnego Centrum Medycyny Cyfrowej.
Projekt jest realizowany przez konsorcjum pięciu podmiotów, z których każdy posiada unikatową wiedzę i kompetencje z zakresu medycyny, nauki i technologii. Wspólne ukierunkowane działania i cele konsorcjum pozwalają na realizacje skomplikowanych przedsięwzięć naukowo-badawczych.
Celem projektu jest przygotowanie zaplecza infrastrukturalnego, systemowego oraz kadrowego pozwalającego na prowadzenie innowacyjnych i unikatowych badań naukowych, a także na stworzenie korzystnych warunków do rozwoju innowacyjnych technologii lekowych, informatycznych i innych mających zastosowanie w ochronie zdrowia.
Przygotowana infrastruktura pozwoli na projektowanie badań klinicznych lub ich elementów z wykorzystaniem zgromadzonych zbiorów danych.
Zebrane dane będą stanowiły podstawę do przygotowania cyfrowych narzędzi o charakterze prognostycznym, predykcyjnym, diagnostycznym i terapeutycznym.
Narzędzia będą oparte o inteligentny system zapytań do baz danych oraz samouczące się algorytmy sztucznej inteligencji. System będzie przechowywał dane kliniczne i omiczne pozyskane z Uniwersyteckiego Szpitala Klinicznego w Opolu. Dane kliniczne pozyskiwane będą m. in. z systemu szpitalnego z wykorzystaniem zbiorów danych dotyczących diagnostyki obrazowej, diagnostyki laboratoryjnej, diagnostyki histopatologicznej, urządzeń monitorujących oraz innych danych przechowywanych w systemie szpitalnym. Dane omiczne wraz z materiałem histopatologicznym będą przechowywane w biobanku.
Biobank Sieć Badawcza Łukasiewicz – PORT Polski Ośrodek Rozwoju Technologii ze względu na ekspertyzę lidera i podjęty rozwój w kierunku patologii doświadczalnej i cyfrowej, będzie wzbogacać biobankowany materiał o dodatkowe dane fenotypowe i cyfrowe. Biobank prowadzony jest przez Sieć Badawcza Łukasiewicz – PORT Polski Ośrodek Rozwoju Technologii zgodnie z obowiązującym systemem jakości Standardy Jakości dla Biobanków PL 2.0 .Sekwencjonowaniem i badaniem zebranych danych omicznych oraz ich czasowym przechowaniem będzie zajmował się Instytut Genetyki Człowieka PAN.
W ramach projektu zostaną przygotowane procesy i platforma cyfrowa wspomagająca realizację programów badawczych w zakresie analizy wyników badań genetycznych i fenotypowania na poziomie tkankowym. Baza danych będzie miała zintegrowany charakter, który pozwoli na jednoczesne korzystanie z danych pochodzących z wielu źródeł. Gromadzone dane cyfrowe w tym informacje i wyniki badań dotyczących danych omicznych będą zanonimizowane, a podczas realizacji projektu i w okresie jego trwałości dostępne dla wszystkich uczestników konsorcjum dzięki zapewnieniu odpowiednich warunków do transferu danych.
Rzeczowym efektem projektu będzie infrastruktura wraz z oprogramowaniem, która będzie obejmować serwery, przestrzeń dyskową dostosowaną do wielkości Regionalnego Centrum Medycyny Cyfrowej. Uniwersytecki Szpital Kliniczny w Opolu posiada zaplecze lokalowe dla sprzętu informatycznego oraz kadrę zarządzającą i obsługującą Regionalne Centrum Medycyny Cyfrowej. Zaplanowano zakup infrastruktury pozwalającej na przesyłanie i integracje danych.
Za procesy związane z przesyłem danych odpowiada Uniwersytet Opolski. Oprogramowanie zostanie przygotowane przez Uniwersytecki Szpital Kliniczny w Opolu oraz Instytut Chemii Bioorganicznej PAN Poznańskie Centrum Superkomputerowo-Sieciowe. Uniwersytecki Szpital Kliniczny w Opolu odpowiadać będzie za opracowanie systemu teleinformatycznego związanego z budową i obsługą hurtowni danych w zakresie umożliwiającym realizacje zadań specyficznych dla projektu, w tym projektowanie i rozwój badań. Instytut Chemii Bioorganicznej PAN Poznańskie Centrum Superkomputerowo-Sieciowe odpowiadać będzie za przygotowanie algorytmów sztucznej inteligencji, moduły realizujące uczenie maszynowe oraz moduł asystenta lekarza.
Działalność badawcza, związana z wykorzystaniem potencjału Regionalnego Centrum Medycyny Cyfrowej już w okresie realizacji projektu oraz po jego zakończeniu będzie koncertowała się przede wszystkim na obszarach badawczych:
dla danych pochodzących z biobankowanych próbek:
- Kompleksowa analiza zmienności genetycznej i zmienności mikrobioty u chorych z otyłością olbrzymią za pomocą sekwencjonowania genomowego;
- Kompleksowa analiza fenotypowa komórek w tkankach pozyskanych od chorych z otyłością olbrzymią wraz z analizą mikrobiomu (bakterii) w tkance in-situ;
- Sekwencjonowanie całego genomu (WGS) u pacjentów z klinicznie rozpoznaną kardiomiopatią przerostową (HCM), u których w badaniach panelowych nie stwierdzono mutacji w genach kodujących białka sarkomeru.
dla danych zbieranych prospektywnie oraz danych opartych o algorytmy AI
- Choroby Wewnętrzne, Kardiologia, Nefrologia, Alergologia - Badanie czynników ryzyka chorób sercowo-naczyniowych, niewydolności nerek, chorób metabolicznych i alergicznych, wpływu stylu życia na te choroby,
- Pediatria - Badanie czynników wpływających na rozwój chorób u dzieci, wzorców wzrostu i rozwoju na podstawie zbieranych danych
